广西检验检疫局切实发挥职能作用，积极服务广西特殊监管区出入境检验检疫工作，促进广西经济发展。

特殊监管区域是按照国家总体战略部署所设立的保税港区、保税区、保税物流园区和出口加工区等区域的总称，它是广西不断扩大对外开放过程中形成的宝贵资源，是落实“一轴两翼”区域合作战略、推动广西北部湾经济区建设区域物流商贸基地的重要载体。

近年来，广西检验检疫局根据自身实际，不断探索特殊监管区域检验检疫监管模式，以服务特殊监管区域经济发展为目标，以优化特殊监管区域投资环境为主题，以解决深层次的体制机制问题为突破口，不断促进行政执法方式更加符合国际通行规则，推动把关服务的质量和效率向国际先进水平靠拢，力求用更科学的管理模式、更先进的技术手段来实现“提速、减负、增效、严密监管”的工作目标。2011年，广西特殊监管区域共检验检疫进出口货物2770批次、涉及货值5亿美元，检出不合格货物19批次，涉及货值544万美元，保障了广西特殊监管区域贸易的顺利开展。